Von der Leyen told a conference at Paris's Sorbonne university that the EU would launch a new incentives package worth 500 million euros ($567 million) to make the 27-nation bloc "a magnet for researchers".
"We have to offer the right incentives," she said.
Without mentioning Trump directly, von der Leyen told the "Choose Europe for Science" conference that the role of science was being put in question "in today's world" and condemned such views as "a gigantic miscalculation".
Universities and research facilities in the United States have come under increasing political and financial pressure under Trump, including with threats of massive federal funding cuts.
"Nobody could have imagined that this great global democracy, whose economic model depends so heavily on free science,.. was going to commit such an error," Macron said.
He added: "We refuse a diktat consisting of any government being able to say you cannot research this or that."
'A sanctuary'
In the context of "threats" against independent research and "global apprehension", Macron said, "Europe must become a sanctuary."
In the United States, research programmes face closure, tens of thousands of federal workers have been fired and foreign students fear possible deportation for their political views.
European commissioners, scientists, academics and ministers for research from EU member countries took part in Monday's conference, as did representatives from non-EU members Norway, Britain and Switzerland.
The French president has already appealed to foreign, notably US, researchers to "choose France".
Last month he unveiled plans for a funding programme to help universities and other research bodies cover the cost of bringing foreign scientists to the country.
Aix Marseille University in the south of France announced in March it would open its doors to US scientists threatened by cuts.
It says its "Safe Place for Science" scheme has already received a flood of applicants.
Last week, France's flagship scientific research centre, the CNRS, launched another initiative aimed at attracting foreign researchers whose work is threatened.
Bridging the pay gap
It is also seeking to tempt back French researchers working abroad, some of whom "don't want to live and raise their children in Trump's United States", according to CNRS President Antoine Petit.
An official in Macron's office said Monday's conference came "at a time when academic freedoms are retreating and under threat in a number of cases".
One obstacle, experts say, is the fact that while EU countries can offer competitive research infrastructure and a high quality of life, research funding and researchers' remuneration both lag far behind US levels.
But the CNRS's Petit said last week he hoped the pay gap would seem less significant once the lower cost of education and health, and more generous social benefits were taken into account.
Macron's office said France and the European Union were targeting researchers in a number of specific sectors, including health, climate, biodiversity, artificial intelligence and space.
Macron said his government would earmark "an additional" 100 million euros to help attract foreign talent.
The French government could finance up to 50 percent of selected research projects, an official in the presidential office said, while assistance could also be offered in the form of tax incentives.
By Pierre Celerier and Jurgen Hecker
Traducerea/subtitrarea/voice-over-ul au fost generate de Inteligența Artificială, fără verificare sau editare umană, și sunt puse la dispoziție „așa cum este”, după cum se specifică în Termenii de utilizare ai platformei.
Von der Leyen a declarat în cadrul unei conferințe la Universitatea Sorbona din Paris că UE va lansa un nou pachet de stimulente în valoare de 500 de milioane de euro (567 de milioane de dolari) pentru a face din blocul celor 27 de națiuni "un magnet pentru cercetători".
"Trebuie să oferim stimulentele potrivite", a spus ea.
Fără a-l menționa direct pe Trump, von der Leyen a declarat la conferința "Choose Europe for Science" că rolul științei este pus sub semnul întrebării "în lumea de astăzi" și a condamnat astfel de opinii ca fiind "o eroare de calcul uriașă".
Universitățile și centrele de cercetare din Statele Unite au fost supuse unei presiuni politice și financiare din ce în ce mai mari sub Trump, inclusiv prin amenințări cu reduceri masive ale fondurilor federale.
"Nimeni nu și-ar fi putut imagina că această mare democrație globală, al cărei model economic depinde atât de mult de știința liberă, ... va comite o astfel de eroare", a declarat Macron.
El a adăugat: "Refuzăm un diktat constând în faptul că orice guvern ar putea spune că nu se poate cerceta asta sau aia".
"Un sanctuar
În contextul "amenințărilor" la adresa cercetării independente și al "aprehensiunii globale", Macron a declarat că "Europa trebuie să devină un sanctuar".
În Statele Unite, programele de cercetare riscă să fie închise, zeci de mii de lucrători federali au fost concediați, iar studenții străini se tem de o posibilă deportare pentru opiniile lor politice.
La conferința de luni au participat comisari europeni, oameni de știință, profesori universitari și miniștri ai cercetării din țările membre ale UE, precum și reprezentanți din Norvegia, Marea Britanie și Elveția, țări care nu sunt membre ale UE.
Președintele francez a făcut deja apel la cercetătorii străini, în special americani, să "aleagă Franța".
Luna trecută, el a dezvăluit planurile pentru un program de finanțare care să ajute universitățile și alte organisme de cercetare să acopere costurile aducerii de oameni de știință străini în țară.
Universitatea Aix Marseille din sudul Franței a anunțat în martie că își va deschide porțile pentru cercetătorii americani amenințați de reduceri.
Aceasta afirmă că programul său "Safe Place for Science" a primit deja o mulțime de solicitanți.
Săptămâna trecută, cel mai important centru de cercetare științifică din Franța, CNRS, a lansat o altă inițiativă menită să atragă cercetători străini ale căror lucrări sunt amenințate.
Reducerea diferențelor salariale
Acesta încearcă, de asemenea, să atragă înapoi cercetătorii francezi care lucrează în străinătate, dintre care unii "nu doresc să trăiască și să își crească copiii în Statele Unite ale lui Trump", potrivit președintelui CNRS, Antoine Petit.
Un oficial din biroul lui Macron a declarat că conferința de luni a avut loc "într-un moment în care libertățile academice se retrag și sunt amenințate într-o serie de cazuri".
Potrivit experților, unul dintre obstacole este faptul că, deși țările UE pot oferi o infrastructură de cercetare competitivă și o calitate a vieții ridicată, finanțarea cercetării și remunerarea cercetătorilor sunt cu mult în urma nivelului din SUA.
Cu toate acestea, Petit de la CNRS a declarat săptămâna trecută că speră ca diferența de remunerare să pară mai puțin semnificativă odată ce se iau în considerare costurile mai scăzute ale educației și sănătății și beneficiile sociale mai generoase.
Biroul lui Macron a declarat că Franța și Uniunea Europeană au vizat cercetători într-o serie de sectoare specifice, inclusiv sănătatea, clima, biodiversitatea, inteligența artificială și spațiul.
Macron a declarat că guvernul său va aloca "o sumă suplimentară" de 100 de milioane de euro pentru a ajuta la atragerea talentelor străine.
Guvernul francez ar putea finanța până la 50 % din proiectele de cercetare selectate, a declarat un oficial din cadrul biroului prezidențial, în timp ce asistența ar putea fi oferită și sub formă de stimulente fiscale.
De Pierre Celerier și Jurgen Hecker